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基序 、蛋白质基序

   日期:2023-04-13     浏览:39    评论:0    
核心提示:什么是网络基序网络的复杂性本质上就是关系的复杂性。但是,研究者通过对真实网络的分析,发现各种关系种类的出现频率是非随机性的。某些特定的关系种类在网络中反复出现,形成网络的典型连接方式;不同类型的网络具

什么是网络基序

网络的复杂性本质上就是关系的复杂性。但是,研究者通过对真实网络的分析,发现各种关系种类的出现频率是非随机性的。某些特定的关系种类在网络中反复出现,形成网络的典型连接方式;不同类型的网络具有不同的典型连接方式。研究者把这些特定的关系种类称为“网络基序”(network motif),认为它们是一个网络的基本构造单元。�0�2�0�2�0�2�0�2 �0�2基序是从功能的角度来分析网络的构成,着眼于网络内各种成分之间连接的模式或关系。而模块则注重从结构的角度来理解网络,寻找网络内由直接相互作用的成分构成的单元。�0�2�0�2�0�2 �0�2模块有两个显著特征:模块内的分子与分子间有着直接的相互作用;模块与模块或模块与非模块之间有着清晰的边界。

结构域(domain)与基序(motif)

相邻的二级结构单元组合在一起,相互作用,形成有规则排列,在空间上能够辨认的二级结构组合体,叫做超二级结构。它是一种介于二级结构与三级结构之间的层次,是进一步构成三级结构的基础。一般由超二级结构组合成结构域,结构域组合成三级结构。也有简单的蛋白是单结构域的。motif中文译成模体或基序等,它在蛋白质结构方面的含义与超二级结构非常相似,也有人认为二者完全相同。不过motif一般指蛋白质种常见的结构元件,而且从功能角度考虑较多,所以并不局限于二级结构组合。例如,在细胞粘附过程中发挥重要作用的RGD motif,就仅仅由Arg-Gly-Asp三肽构成。这个模体已经在多种蛋白中发现,而且至少有8种整联蛋白超家族成员识别这个三肽序列。

基+序抄2默1是什么意思

您是问基序抄2默1是什么意思吗?抄写两遍,默写一遍。基序,亦称模序、模体。是指DNA、蛋白质等生物大分子中的保守序列,介于二级和三级结构之间的另一种结构层次。

网络基序和网络模块的区别与联系

类型不同,网络关系的联系。

1、网络基序是网络的关系单元,是系统生物学的生物网络分析的初级形式,它为模块的分析和合成生物学提供了理论和实验的范本,网络基序需要用更多的网络,更多的在体实验分析。

2、网络模块网络的结构单元基因调控网络数据库,网络模块分发射端模块和接收端模块,是分别用于网桥主、从两端的主模块。信号发射模块负责发射信号,信号接受模块负责接收信号。

基序和结构域有什么区别

基序和结构域的区别:

基序,亦称模序、模体。是指DNA、蛋白质等生物大分子中的保守序列,介于二级和三级结构之间的另一种结构层次。所谓结构域指蛋白质亚基结构中明显分开的紧密球状结构区域,亦称辖区。多肽链首先是在某些区域相邻的氨基酸残基形成有规则的二级结构,然后,又由相邻的二级结构片段集装在一起形成超二级结构,在此基础上多肽链折叠成近似于球状的三级结构。

结构域(domain)是位于超二级结构和三级结构间的一个层次。结构域是在蛋白质的三级结构内的独立折叠单元,通常都是几个超二级结构单元的组合。在较大的蛋白质分子中,由于多肽链上相邻的超二级结构紧密联系,进一步折叠形成一个或多个相对独立的致密三维实体,即结构域。

结构域的结构

在蛋白质三级结构内的独立折叠单元。结构域通常都是几个超二级结构单元的组合至蛋白质多肽链在二级结构的基础上进一步卷曲折叠成几个相对独立的近似球形的组装体。

结构域(Structural Domain)是介于二级和三级结构之间的另一种结构层次。所谓结构域是指蛋白质亚基结构中明显分开的紧密球状结构区域,又称为辖区。多肽链首先是在某些区域相邻的氨基酸残基形成有规则的二级结构,然后,又由相邻的二级结构片段集装在一起形成超二级结构,在此基础上多肽链折叠成近似于球状的三级结构。

对于较大的蛋白质分子或亚基,多肽链往往由两个或多个在空间上可明显区分的、相对独立的区域性结构缔合而成三级结构,这种相对独立的区域性结构就称为结构域。对于较小的蛋白质分子或亚基来说,结构域和它的三级结构往往是一个意思,也就是说这些蛋白质或亚基是单结构域。结构域自身是紧密装配的,但结构域与结构域之间关系松懈。

结构域与结构域之间常常有一段长短不等的肽链相连,形成所谓铰链区。不同蛋白质分子中结构域的数目不同,同一蛋白质分子中的几个结构域彼此相似或很不相同。常见结构域的氨基酸残基数在100~400个之间,最小的结构域只有40~50个氨基酸残基,大的结构域可超过400个氨基酸残基。

motif 在分子生物学中是什么意思 ?怎么翻译???

motif是在许多蛋白质分子中,由几个具有二级结构的肽段在空间上相互接近、相互作用,所形成的折叠模样称为超二级结构,又称为模体。锌指结构是一种常见的模体。

motif在生物学中是一个基于数据的数学统计模型,典型的是一段sequence也可以是一个结构,是特定的group的序列预测,例如一个DNA sequence可以定义为转录因子结合位点,也就是序列倾向于被这种factor结合。

对蛋白质来说,sequence motifs可以被定义为蛋白质(蛋白质序列)属于一个给定的蛋白质家族。一个简单的motif可以是,例如,一个模式pattern,而这个模式被这个group中的所有成员共享。

例如WTRXEKXXY(这里,X代表任何氨基酸)。当然也有更复杂的motif模型。Motif有时和特定的功能联系一起。

motif在生物学上翻译成,模体,模序,基序等。

扩展资料

常见模体:

1、左手超螺旋——3根右手α-螺旋拧到一起形成一个左手超螺旋;

2、右手超螺旋——3根左手螺旋拧到一起形成一个右手超螺旋,如胶原蛋白;

3、卷曲螺旋——相邻的2根右手α-螺旋拧到一起形成一个左手超螺旋;

4、螺旋束——多个α-螺旋的聚合体;

5、β-折叠-α-螺旋β-折叠,即βαβ;

6、β-发夹环——两个反平行β-股由一个环相连;

7、α-螺旋-β-转角-α-螺旋,即αβα;

8、α-螺旋-环-α-螺旋(EF手相);

9、Ros***ann卷曲——也称Ros***ann折叠,它由两个βαβ连在一起,形成βαβαβ结构,通常能结合辅酶I;

10、希腊钥匙模体——是一种全β折叠聚合体,存在于许多不同类型的蛋白质中,因在拓扑学上像古代花瓶上的希腊钥匙而得名,清蛋白原就含有这种模体。

参考资料:百度百科-模体

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原文链接:http://www.hzciic.com/news/show-22015.html,转载和复制请保留此链接。
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标签: 结构 蛋白质 网络
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